Biohub - Cell Tracking During Development

适合专业与项目难度

三维细胞影像和分裂谱系直接关联生物信息学、生物医学工程与计算生物学；检测、时序关联和图优化对应计算机、机器学习与数学。生物学背景适合任务解释和标注质检，模型实现仍需编程基础。

为什么评为高级？

供稿明确标为入门难度高：需同时处理 3D 体数据、跨帧轨迹和细胞分裂，检测误差会传递到追踪图与组合指标。

等级说明：跨多阶段或研究型系统，涉及复杂数据、模型/算力约束或强领域先修知识。

建议具备的基础

• Python、NumPy 与深度学习基础
• 3D 图像坐标和体素尺度
• 目标关联或图算法基础

可以从哪里开始

先在少量切片或小体积数据上建立检测与最近邻关联基线，再加入分裂事件和全局优化。

专业与难度由本站根据项目文档分析，面向基线复现与对照实验；具体门槛取决于承担的任务和项目深度。 这不是 Kaggle 官方评级。

先把任务说清楚

这是一个四维细胞检测与追踪问题：模型需要在连续时间点的三维体数据中找到细胞，并把同一细胞及其分裂关系连接起来。评分同时关注检测与谱系关系，因此单帧识别和跨帧关联必须一起设计。

技术路线

1. 数据

   读取与质检

   统一时间轴、体素间距和坐标系，先可视化少量切片确认标注是否对齐。

2. 检测

   检测基线

   建立逐帧候选点或实例分割基线，单独报告检测召回率和定位误差。

3. 追踪

   时序关联

   结合位移、形态与外观建立跨帧匹配，并为细胞分裂设置独立候选和约束。

4. 验证

   端到端验证

   同时核验 node/edge 文件、调整后的 edge Jaccard 与 division Jaccard，保留失败轨迹。

组队时间窗口

Team Merger deadline

2026年9月22日

Final submission deadline

2026年9月29日

Competition End Date

官方结束日期待核验

预计结果日期

2026年10月6日，Final Submission 后增加 7 个自然日

预计结果日期用于时间适配，不代表官方奖项发布日期或结果承诺。

规则与提交信息

公开分类

CV

最大队伍人数

5

评价指标

adjusted edge Jaccard + 0.1 × division Jaccard

提交文件

submission.csv

运行上限

Notebook 约 12 小时

• 每日最多提交 5 次，最终计分提交最多 2 个
• 按官方页面要求组队，提交格式与数据使用以 Rules 为准

比赛状态、Rules、提交限制和赛程可能变化，请以 Kaggle 官方页面为准。

证据边界：非实时图表，用于理解公开方案与讨论；分数和票数不代表最终排名或本站团队成绩。

公开研究资料

以下图表基于公开页面整理，用于理解公开方案与讨论主题。数据会变化，不作为成绩、排名或结果承诺。

协作重点与可交付成果

复盘与面试可以讲什么

• 为什么检测正确不等于追踪正确
• 如何处理体素尺度、遮挡和细胞分裂
• 如何拆解组合指标并定位误差来源

适合用途

数据状态与官方来源

当前赛程状态为“已核验”。 团队、资格、数据、模型、代码共享和提交方式以单场 Rules 最新内容为准。